近日,美国《国度科学院院刊》(PNAS)以封面论文及同期亮点保举的情势,发表了中国科学院南海海洋研究所(如下简称南海海洋所)研究员三木SEO-林强团队与互助者的最新研究结果。他们聚焦海龙科鱼类对于珊瑚共栖的顺应进化机制,乐成解密了珊瑚礁共栖物种形成与顺应进化的遗传调控机制,为生物多样性研究提供了全新视角。 “于国度天然科学基金、国度重点研发规划等项目的资助下,咱们以典型的珊瑚礁共生物种豆丁海马为研究对于象,解析了其体型小型化及拟态演化的要害遗传因素,验证了hoxa2b基因对于鱼类颌面骨骼发育的主要调控功效,并初次提出珊瑚能驱动其共栖物种小型化的新不雅点。”论文配合通信作者林强对于《中国科学报》暗示。 《国度科学院院刊》编纂及审稿人对于该项研究赐与了高度评价。他们认为,豆丁海马作为珊瑚礁共生的典型代表,研究团队经由过程详确的数据及深切的阐发,展现了其怪异的小型化、拟态及免疫等遗传特性,是一项十分有趣且成心义的事情。 ? 豆丁海马与珊瑚共生之谜 海洋生物的发源、演化和多样性形成机制一直是国际学界的热门问题。于广袤的海洋中,珊瑚礁生态体系以其极高的生物多样性脱颖而出,成为浩繁海洋新生命的摇篮。于漫长的演化过程中,珊瑚礁物种为顺应情况,演化出多彩体色及个别小型化等特性。 豆丁海马可谓珊瑚礁中的“假装巨匠”,它是已经知体型最小的硬骨鱼类之一,成体全长仅1-2厘米,终生专性栖息于柳珊瑚上。与其他海马差别,豆丁海马没有育儿袋布局,胚胎植入雄鱼体内发育,形成为了怪异的“雄性体内有身”模式。 为了更好地融入宿主柳珊瑚情况,豆丁海马全身笼罩近似柳珊瑚的瘤状结节,“长吻”退化,与柳珊瑚于视觉上险些融为一体,可谓天然界的“假装妙手”。 然而,柳珊瑚排泄的毒素属在天然界中最致命的自然毒素之一,这给豆丁海马与柳珊瑚的零间隔接触带来了严重挑战。二者之间这类怪异的附生瓜葛是怎样形成的?柳珊瑚又是怎样驱动豆丁海马体型演化的?这些问题一直是学界存眷的核心。 为相识开这些谜题,林强团队结合德国康斯坦茨年夜学传授、南海海洋所特聘研究员Axel Meyer等科研职员,对于豆丁海马睁开了多组学及生物试验解析。研究发明,宿主珊瑚不仅“驱动”其假装能力演化,还有转变其免疫能力,使其免疫能力显著削弱,重要依赖珊瑚排泄的抗菌抗病毒活性物资实现免疫功效。 论文配合第一作者、南海海洋所副研究员曲朦暗示,于与珊瑚共生演化历程中,珊瑚排泄物对于豆丁海马的保存是一把“双刃剑”。一方面,豆丁海马的神经传导及离子通道相干基因发生了显著的快速进化,注解它们可能衍生出对于珊瑚毒素更强的耐受或者抵挡能力;另外一方面,豆丁海马可以或许使用宿主珊瑚排泄物的免疫掩护功效来抵御外源病原体,这可能与豆丁海马年夜量丢掉免疫相干基因存于协同演化瓜葛。 “豆丁海马的演化历程遭到宿主珊瑚的影响。豆丁海马采纳‘免疫精简’计谋,既降低了能量耗损,又有用防止了胚胎着床历程中的免疫排斥反映,有助在‘雄性体内有身’模式的形成。”曲朦称,这类高度依靠宿主、经由过程自动“精简”自身基因组获取保存上风的历程,切合生物学中的“黑皇后假说”,即生物舍弃某些“昂贵”功效,依靠“伙伴”提供。 “雄性有身”的豆丁海马 豆丁海马怪异的“雄性有身”模式,不仅是一种奇异的孳生方式,也蕴含着深刻的保存计谋。然而,于持久的演化历程中,这类顺应辐射也可能带来潜于的保存危害。 ? 豆丁海马对于柳珊瑚的依靠性已经不成逆转。一旦全世界天气变化及人类勾当威逼到其特定的珊瑚礁生态体系,豆丁海马等依靠性物种将面对严重的保存挑战。 “该研究从构想到发表历经约5年,最年夜坚苦是试验样品问题。”论文配合第一作者、南海海洋所博士后张颖懿暗示。豆丁海马罕见且没法人工养殖,许多生物学试验没法于其身上操作。研究团队选择线纹海马作为替换举行发育生物学相干试验。同时,因为“雄性有身”,海龙科鱼类均没法举行CRISPR基因编纂操作,研究团队利用模式物种斑马鱼举行基因编纂后续验证明验。 该研究发明,豆丁海马基因组中丢掉了年夜量与体型巨细及颌面骨骼发育相干的守旧非编码区(CNE)。经由过程联合RNA-seq、ATAC-seq等数据的比力研究,研究团队发明这些丢掉的CNE可以或许调控相干基因的表达模式,进而影响颌面骨骼的生长发育历程。 惹人注目的是,hoxa2b基因发生了假基因化,即掉去了功效。基在CRISPR基因编纂试验,团队进一步证明敲除了hoxa2b基因会致使鱼类颌面骨骼发育畸形。由此,团队患上出结论:CNE丢掉及要害基因(如hoxa2b)的功效突变,是驱动豆丁海马体型极端小型化及短吻表型的要害遗传因素。 闻名遗传学家、西班牙巴塞罗那年夜学传授Cristian Cañestro指出:“于生命的演化中,基因丢掉征象十分遍及。但这项精彩的研究提供了一个清楚的例证,申明基因丢掉有时反而能带来益处,从而促进进化上的立异及顺应性变化”。 英国海洋生物学家Richard Smith暗示:“该研究展现了一种残暴的征象。这些海马之以是可以或许乐成繁衍,恰是患上益在它们具有的一些特性,如完善的假装能力、小巧的体型以和怪异的心理布局,但如今这些特性偏偏成为了它们应答情况变化最年夜的弱点”。 海龙科鱼类研究的广漠远景 珊瑚礁生物多样性是海洋的无价之宝,其物种多样性及遗传多样性成因是生物学界焦点问题之一。此中,繁杂的生物共生瓜葛是珊瑚礁生态体系多样性形成的要害支撑,但除了少数经典共生(如虫黄藻-珊瑚虫)外,其他生物彼此作用机制仍存于年夜片未知。 ? “豆丁海马与柳珊瑚的共生瓜葛,是共生驱动物种进化的典型例子,为生物多样性研究提供了新的理论及范式。”林强指出,豆丁海马终生专性栖息于柳珊瑚上,柳珊瑚为其提供呵护,于持久配合演化中,豆丁海马演化出与柳珊瑚高度相似的外表,这是数百万年进化留下的模拟“先天”。 作为进化速度最快、多样性最为富厚的硬骨鱼类群之一,海龙科鱼类是一类具备怪异“雄性有身”特性的奇异物种,广泛漫衍在全世界热带及温带海疆。其奇异形态与孳生方式使其成为研究全世界扩散与定殖模式的主要旗舰类群。 多年来,林强团队缭绕海龙科物种顺应性进化历程开展研究,前期已经明确诸多繁杂性状的进化与遗传调控机制。然而,近期查询拜访发明部门海龙科物种因栖息珊瑚而发生了完善的拟态举动,以提高其保存时机。这类对于珊瑚礁生态体系的特异性顺应机理今朝尚缺少相干研究。 如今,林强团队的研究不仅展现了豆丁海马与柳珊瑚之间的协同进化机制,还有为生物彼此作用驱动的演化立异提供了新的视角。将来,跟着研究的不停深切,咱们有望揭开更多海洋生物进化的秘密,为掩护海洋生物多样性孝敬更多聪明及气力。 下一步,该团队将眼光拓展至整个海龙目,明确海龙目鱼类物种演化汗青及地舆漫衍格式特性,诠释其顺应辐射纪律及物种高度多样化的成因;展现其顺应演化纪律,特别是“雄性有身”模式的演化历程;探究其遗传懦弱性特性,解析对于将来天气变化的相应模式,提出物种多样性掩护计谋。 相干论文信息:https://doi.org/10.1073/pnas.2423818122
当期期刊封面。研究团队供图,下同
豆丁海马对于宿主柳珊瑚的拟态表型。
豆丁海马与珊瑚共生的遗传调控机制。